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¿Cómo se constituye el genoma humano?
Llamamos genoma al conjunto de todo el ADN de una célula de una especie y los genes que éste contiene. En sentido estricto, el genoma humano no sólo comprende al ADN del núcleo sino también al de las mitocondrias que, aunque sólo tiene 16.000 bases de longitud, es esencial para el funcionamiento celular.
¿Qué es el ensamblaje de novo?
El ensamblaje de novo es uno de los procedimientos empleados para reconstruir genomas, principalmente bacterianos. En este artículo se revisan las principales tendencias en la secuenciación y, específicamente, en el ensamblaje de novo.
¿Cómo hacer una secuencia consenso?
La obtención de una «secuencia consenso», se realiza comparando las secuencias disponibles, obtenidas de varios fraccionamientos bioquímicos de los componentes de una o más moléculas.
¿Qué es un read en bioinformatica?
Lecturas o secuencia del ADN continua obtenida de un secuenciador. Es la cobertura o la parte estimada del genoma que ha sido secuenciada.
¿Qué es una secuencia de consenso?
Secuencia ideal que representan los nucleótidos o aminoácidos que se encuentran con mayor frecuencia en cada posición de un fragmento de DNA o de una proteína, respectivamente.
¿Qué significa secuencia de consenso?
Representa los resultados de alineaciones de secuencia múltiples en las que las secuencias relacionadas se comparan entre sí y se calculan motivos de secuencia similares.
¿Cómo se procesa el genoma?
Este genoma se procesará de manera diferente en cada tipo celular tal y como hemos explicado en nuestro reciente artículo: El orden en el que las cuatro letras A, C, G y T están escritas en un genoma es lo que se conoce como su secuencia.
¿Cuánto cuesta secuenciar un genoma?
Para observar mejor las enormes diferencias encontradas, se representa el coste por genoma en una escala logarítmica. En el año 2001 secuenciar un genoma costaba unos 100 millones de dólares USA mientras que hoy en día hacer lo mismo cuesta tan sólo 1000 dólares USA.
¿Cuál es la mitad del genoma humano?
Por otra parte, sí es cierto que el genoma humano como tal es la mitad y se habla de entre 3000 y 3200 Mps. SOlo disponer de dos cromosomas XX o XY ya varía mucho la longitu en unos 100Mbp ya que en números redondos el X son 150 Mpbs i el Y son 50 Mbp.
¿Cuáles son las bases de datos genómicas más importantes?
Las bases de datos genómicas públicas más importantes son NCBI (National Center for Biotechnology Information, EEUU), ENA (European Nucleotide Archive, Reino Unido) y DDBJ (DNA Database of Japan, Japón).
https://www.youtube.com/watch?v=v6QhYd2P3rA